Термални бицикличар: Термални бициклизам је основна компонента ПЦР анализатора, која се користи за контролу цикличке реакције реакционог ензима и циљног узорка на различитим температурама. Термални бициклир може постићи брзу промену температуре кроз пелтирске елементе или друге технологије и одржавати одређену температуру у сваком циклусу. Термални бициклир обично укључује један или више реакционих модула, од којих сваки може самостално контролисати температуру и време за постизање истодобног откривања више узорака.
Оптички систем: оптички систем се користи за откривање и мерење флуоресцентног сигнала генерисаног ПЦР реакције. Оптички систем може одредити присуство и количину мете узбудљивом флуоресцентном маркеру (као што је ФАМ, ХЕКС или РОКС) и откривање његовог интензитета флуоресценције. Оптички систем обично укључује један или више извора лампица за узбуђење, као што су ЛЕД или ласерска светла и детектор флуоресценције, као што је ПМТ (фотокомултиплиплиер цев) или ЦЦД (електронски чип за слике).
Софтверски систем: Софтверски систем се користи за контролу рада и анализе података ПЦР анализатора. Генерално, софтверски систем ПЦР анализатора може поставити реакционе услове, надгледа реакциони напредак, бележити податке реакције и анализирати резултате. Софтверски систем се може повезати на ПЦР анализатор путем УСБ, серијског порта или мреже и пружа графичко интерфејс и алате за анализу података.
Систем узорковања: Систем узорковања користи се за учитавање и померање ПЦР реакције система. Типично, систем узорковања може аутоматски оптеретити узорке и друга једињења, као што су прајмери и ензими и помешати их и пребацити пре него што започне реакција. Систем узорковања може постићи уметност узорака и достизање цеви, шприцама или другим средствима.
Систем круга: Систем круга користи се за контролу и праћење радног статуса ПЦР анализатора, укључујући температуру, време, интензитет флуоресценције и друге параметре. Систем круга може да спроведе микроконтролер, дигитални сигнални процесор или друге електронске компоненте.
Механички систем: Механички систем се користи за померање, прилагођавање и контролу механичких делова ПЦР анализатора, као што је топлотни бициклизам, оптички систем и систем узорковања. Механички систем може да проведе преносним системом, погонским системом и сензорским системом.